สถาบันนโยบายสาธารณะ ม.อ. (Public Policy Institute of PSU) เป็นการพัฒนาและยกระดับหน่วยงานภายในมหาวิทยาลัยเดิม คือ สถาบันการจัดการระบบสุขภาพ (สจรส.ม.อ.)

ที่ผ่านมาสถาบันนโยบายสาธารณะ ม.อ. เป็นหน่วยงานอิสระกลางภายในมหาวิทยาลัยที่เป็นลักษณะของสถาบันเครือข่ายที่มิใช่ส่วนราชการ ทำหน้าที่จัดการงานวิจัยเพื่อการพัฒนาระบบสุขภาพของภาคใต้ ก่อตั้งขึ้นภายใต้ความร่วมมือระหว่างมหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ และสถาบันวิจัยสาธารณสุข (สวรส.) ตามพันธะที่ได้มีพิธีลงนามความร่วมมือในการจัดตั้งสถาบัน เมื่อวันที่ 25 เมษายน 2546 รวมเป็นระยะเวลา 6 ปี